In silico analysis of molecular docking between nicotine and GSTP1 gene in oral squamous cell carcinoma
PDF
Atıf
Paylaş
Talep
Özgün Araştırma
CİLT: 26 SAYI: 2
P: 135 - 142
Ekim 2025

In silico analysis of molecular docking between nicotine and GSTP1 gene in oral squamous cell carcinoma

Trakya Univ J Nat Sci 2025;26(2):135-142
Bilgi mevcut değil.
Bilgi mevcut değil
Alındığı Tarih: 24.01.2025
Kabul Tarihi: 10.06.2025
Online Tarih: 15.10.2025
Yayın Tarihi: 15.10.2025
E-Pub Tarihi: 11.07.2025
PDF
Atıf
Paylaş
Talep

Özet

Oral skuamöz hücreli karsinom (OSHK), tütün kullanımı, viral enfeksiyonlar ve genetik yatkınlıklar gibi risk faktörleriyle güçlü ilişkilide olan baskın bir kanser tipidir. Genetik risk faktörleri arasında genellikle çeşitli biyolojik yolaklar için kritik olan gen polimorfizmleri yer almaktadır. Glutatyon S-transferaz pi 1 (GSTP1), oral kanserojenlerin detoksifikasyonunda rol oynayan bir gendir veGSTP1’in Ile105Val varyantı, OSHK dahil olmak üzere kanser gelişimi riskinin artmasıyla ilişkilidir.GSTP1ile nikotin gibi kanserojenler arasındaki etkileşimin anlaşılması, OSHK ilerlemesi konusunda değerli bilgiler sunmaktadır. Bu çalışmada, nikotin ve GSTP1arasındaki bağlanma afinitesini keşfetmek için moleküler yerleştirme tekniğiylein silicotarama kullanılmıştır. İlaç benzerliği ve farmakokinetik değerlendirmeler için PubChem’den kanonik SMILES kullanılmıştır. ToxiM platformu aracılığıyla yapılan toksisite değerlendirmesinin yanı sıra, yerleştirme analizi -7,1 kcal/mol puanlık güçlü bir bağlanma afinitesi ortaya koymuştur. Etkileşim, 3,579 Å’da TYR109 ile bir Pi–sigma bağı ve PHE9, ARG14 ve ILE105 ile Pi-alkil bağları ile stabilize edilmiştir. Bu bulgular, GSTP1’in, özellikle Ile105Val varyantının OSHK ilerlemesindeki kritik rolünü vurgular niteliktedir. Sonuçlar, GSTP1’in kanserojen detoksifikasyonuna katılımını vurgulamış ve OSHK’nın biyokimyasal yollarının daha iyi anlaşılmasına katkıda bulunmuştur.

Anahtar Kelimeler: