Özet

Bu çalışma, Potentilla cinsindeki filogenetik ilişkileri belirlemek ve trnL/trnF IGS bölgesinin önemini değerlendirmek amacıyla yapılmıştır. Analizlerde daha etkili, doğru ve tutarlı sonuçlar elde etmek için DNA barkodlama bölgesinin seçimi çalışmanın başarılı olmasındaki en önemli noktalardan biridir. Bu amaçla, NCBI’den elde edilen kloroplast DNA’ya ait trnL/trnF IGS sekans bilgisi temelinde 71 Potentilla taksonu incelendi ve MP dendrogram çizildi. trnL/trnF IGS bölgesi barkodlama bölgesi olarak uygun sekans uzunluğuna sahiptir ve ayrıca yüksek varyasyon ve parsim info bölgelere sahip bu bölgenin kullanılması önerilir. trnL/trnF IGS bölgesi için bir bazdan başka bir baza değişim olasılıkları incelendiğinde, %57,13 ile transisyonel baz değişimlerinin, transversiyonel değişimlere oranla daha yüksek olduğu belirlenmiştir. MP dendrogram, incelenen taksonların Fragarioides, Reptans, Anserina, Alba, Himalayan ve Argentea olarak altı gruba yerleştirildiğini ortaya çıkardı. Bu çalışmada en fazla türle temsil edilen Argentea’da filogenetik ilişkilerin diğerleri ile karşılaştırmada oldukça karmaşık olduğu görülmüştür. En doğru sonuçların alınabilmesi için, en iyi sonucu veren bölgelerin belirlenmesi, daha sonra mümkün olduğu kadar çok takson ile belirlenen bu bölgelerin birlikte kullanılması gerekir. Sonuç olarak, çalışılan taksonlar için yüksek varyasyon gösteren bölgelere ve guruplama yeteneğine sahip olan trnL/trnF IGS sekans bilgilerinin kullanılması tavsiye edilir.